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Die ersten Anzeichen der Babesiose treten in der Regel l - 3 Wochen nach der Ansteckung auf. Typische Symptome sind Fieber, Abgeschlagenheit, fehlender Appetit, starker Gewichtsverlust und schwächer werdende Kondition. Blutarmut und Gelbsuchtsowie Blutungen in der Haut und den Schleimhäuten können folgen. Typisch sind außerdem Entzüdungen am Auge mit einer Netzhautablösung. Ist das zentrale Nervensystem betroffen,kommt es zu Bewegungsstörungen oder auch epileptiformen Anfällen. Die Diagnose kann anhand einer Blut Untersuchung gestellt werden.
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